Město Vodňany leží v malebné krajině Jižních Čech a je situováno v severozápadním okraji Českobudějovické pánve v blízkosti řeky Blanice. Nachází se 30 km od Českých Budějovic, v polovině cesty z Českých Budějovic do Strakonic nebo Písku.
Hotel Prajer se nachází v rohu hlavního náměstí Svobody, v místě kde se setkává ulice ČSLA a A. Křížka.TEL:608 029 547
Vlakové nádraží Vodňany je cca 200m od hotelu.